
23日出刊的《科学》期刊指出,科学家利用改良的Hi-C方法来排列基因组,只需要1万美元和数周时间,便可排列出传染兹卡病毒的蚊子基因,可望降低传染率。
相较2003年,美国国防部和国家卫生研究院宣布耗时13年、斥资27亿美元,终将30亿对人类去氧核醣核酸硷基对排序完成。这就像是在显微镜版的《威利在哪里》,必须在30亿人中找出威利。
过去科学家利用电脑将基因密码的小片段串连起来,但却无法确定各片段相连的位置,原因是细胞里的DNA并非只是一条长链分子,2公尺长的DNA像摺纸一样,相互摺叠藏在细胞核中。错综複杂的基因排序有如缺少片段的迷宫。
如今,麻省理工学院、贝勒医学院和哈佛大学的科学家,透过改良Hi-C技术,将传播兹卡病毒的埃及伊蚊和传播西尼罗病毒的热带家蚊的94%基因组,放到这些蚊子的三个染色体支架上,这项“3D排列”技术可让DNA皱摺引导基因排列。染色体支架可让科学家推断出不同基因片段的相对位置,有助了解不同的基因结合会有何特点。
科学家认为这项技术的研究对象不只病患和蚊子。基因科学家艾登表示:“基因重组是透过排列基因的Scratch程式产生,3D排列可适用于许多物种,而且这项技术相当简单。”